Pri opisu vremenskih razmer na Zaplani je pomembno predvsem dejstvo, da leži Spodnja Zaplana v pasu temperaturne inverzije, Zgornja Zaplana pa ne. To potrjuje megla, ki se pojavlja na Spodnji Zaplani, Zgornja Zaplana pa sega že nad inverzijsko meglo. Na Spodnji Zaplani je nekaj plitvih vrtač s pojavom izredno močne temperaturne inverzije, saj se v njih slana lahko pojavi tudi v poletnih mesecih.
Najvišje dnevne temperature so razmeroma nizke zaradi krajevnega vetra (severovzhodnik), ki piha podnevi iz globoke soteske reke Bele. Ker se veter dviguje glede na nadmorsko višino se pri tem adiabatno ohlaja, tako temperatura na Zaplani redko preseže 28°C. Najbolj vroče je na Zaplani v dneh s sončnim vremenom in jugozahodnim vetrom.